Remove graphannis-python and generate GraphML directly

Das Ganze hier enthält:

• Private Methoden, die mehr funktional formuliert sind: Weniger Mutation, reine Funktionen wo möglich.
• Das graphannis-Modul wurde entfernt.

Und wurde rebased auf den refactor_class-Branch, sodass es unsere Änderungen von der letzten Woche mit einschließt.